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智东西公开课
基于FPGA的专用超算系统设计与应用
异构算力系列课 2021/04/26 19:00:00
课程讲师
盛楠 雪湖科技 生命科学计算首席科学家

原中科院上海高等研究院副研究员。从事高性能科学计算领域研究超过14年,曾参与全球著名蛋白质动力学软件GROMACS的开发。在分子动力学、流体力学、计算化学和理论生物学方面有深入研究,发表SCI期刊文章二十余篇。在雪湖科技负责主持开发面向新药研发的生命科学计算专用超算,带领团队获得2020年全球自适应计算挑战赛(Adaptive Computing Challenge 2020)第二名。

盛楠
雪湖科技 生命科学计算首席科学家

原中科院上海高等研究院副研究员。从事高性能科学计算领域研究超过14年,曾参与全球著名蛋白质动力学软件GROMACS的开发。在分子动力学、流体力学、计算化学和理论生物学方面有深入研究,发表SCI期刊文章二十余篇。在雪湖科技负责主持开发面向新药研发的生命科学计算专用超算,带领团队获得2020年全球自适应计算挑战赛(Adaptive Computing Challenge 2020)第二名。

课程提纲
  • 专用超算发展现状
  • FPGA在专用超算领域的优势和设计难点
  • 基于FPGA的超算系统Yaddle设计实现
  • 超算系统Yaddle在分子动力学中的应用
课程简介

伴随数字经济下算力需求的激增,以及人工智能的高速发展,专用超算作为通用超算的补充逐渐进入科研人员的视野,并且已经有很多行业正在探索或者已经实现了由“通”到“专”,例如地震勘探、生命科学、自动驾驶等。

针对不同架构的处理器,专用超算的设计思路也各不相同。CPU的优势在于全局管理和计算控制,GPU的优势在于大规模并行数值运算,FPGA的优势在于灵活性。其中,FPGA由于没有固定的架构,开发者可以自主设计底层逻辑电路,既可以针对通讯密集型任务设计高通量低延时的架构,又可以针对计算密集型任务设计长流水并行化架构,特别适合针对特定计算任务设计专用架构,充分发挥每一比特的算力。然而,FPGA开发是设计电路而不是编写程序,开发难度大,技术水平要求较高,具有很高的技术门槛。

4月26日,「异构算力系列课」第三讲将开讲,由雪湖科技生命科学计算首席科学家盛楠博士主讲,主题为《基于FPGA的专用超算系统设计与应用》。

盛楠博士将从专用超算的发展现状、FPGA在专用超算领域的优势和设计难点切入,并结合雪湖科技基于FPGA的超算系统Yaddle设计实现,及其在分子动力学中的应用,系统讲解基于FPGA的超算系统设计与应用。

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