Nature-Springer SCI期刊"Interdisciplinary Sciences – Computational Life Sciences"主编， “J. Mol. Graph and Modeling”, "Molecular Simulation"，“Scientific Reports”等10家杂志编委。发表SCI文章300多篇， 主编专著9部，SCI引用 超过 8000次， H因子50获得横山亮次(Yokoyama Ryōji)奖，上海交大科学技术奖，中华医学奖，上海市科学进步一等奖, 计算机协会自然科学二等奖和上海市优博导师称号。卫生信息学会大数据应用评估与保障专业委员会副主委、国际交叉科学学会会长。主持国家重点研发领域, 国家“863”，“973”，基金委重点的项目。将现代计算机药物设计方法和中药有效成分等数据库应用到药物设计和分子优化的实践中，比如，病毒(SARS,HIV,H5N1,H1N1)和老年痴呆等疾病的药物设计。 发现了花椒有效成分WGX-50的抗衰老作用，对CYP450酶进行了系统研究，从不同人的基因多态性出发，研究酶对药物代谢动力学的规律，对个性化用药和药物设计进行了初步探索。最近在A型流感病毒M2跨膜蛋白质子通道分子调控机制的研究中取得重要进展，它解释了相互矛盾的实验现象，有助于阐释药物调控离子通道的机理，对于药物设计有一定的指导作用。